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This page describe the distribution content and how to run each of the 3 availables modes, after briefly presenting them.

To install IRMa you only have to unzip IRMa-<version>.zip file on your local system. Under the main directory, the following structure will ne available :

  > auto : directiry containing script samples for the automatique or batch mode. 
  > db : Identification database creation script. Migration scripts for //old// identification databases will also be stored here. They will allow user to use existing databases with the new DB model needed for new IRMa version. 
  > lib : libs and dll needed by IRMa
  > VBscripts: Visual Basic scripts used to launch IRMa from Mascot Daemon. IRMa will be executed in automatique mode. 
  > IRMa-<version>.jar : IRMa librairy specific code
  > *.bat : batch to run IRMa in specific mode. See following sections.  

Run batch file run.bat.
A graphical interface will allow user to validate a Mascot identification result. Help on validation and others features is accessible in user guide.

Note
To validate big Mascot idenitification, it is possible to increase memory used by the application: Edit run.bat file and change the value parameter in -Xmx<value>m attribute. This value correspond to the amount of memory which will be allocated to IRMa, in Mo. Be carreful to not Il est possible de modifier la mémoire occupée par IRMa. Pour cela il faut éditer le fichier run.bat et modifier le paramètre -Xmx<valeur>m. La valeur correspondant à la taille mémoire maximale allouée à IRMa en Mo. Attention cette valeur ne doit pas être équivalente (ou supérieur) à la taille disponible sur l'ordinateur.

Pour cela exécuter le fichier runBatch.bat.
Le mode batch permet d'enchainer un ensemble d'opérations de façon automatique, et cela sur un ensemble d'identification Mascot ou de projets IRMa préalablement sauvegardés.

La description complète de la configuration d'IRMa Batch

Attention le fichier runBatch.bat est un exemple d'utilisation.

Le mode auto permet d'enchainer un ensemble d'opérations, décrit dans un fichier de script équivalent à celui utilisé pour le mode batch, sur une identification donnée. Ce mode n'a donc aucune interface utilisateur.