http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/ 2026-04-17T12:36:56+0200 http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/ http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/lib/tpl/dokuwiki/images/favicon.ico text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epback&rev=1222935666&do=diff Introduction eP-Back s’inscrit dans le cadre d'ePIMS qui est un système de gestions des données issues de la plateforme protéomique. L’objectif de ce système est de conserver une trace des données produites et de faire de ce système un outil de travail quotidien. text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epbackconfiguration&rev=1222935666&do=diff Configuration 1. Choix de l'instrument Pour choisir l'instrument sur lequel récupérer ou supprimer les données il suffit de le choisir dans la liste proposé (voir partie1 sur la figure 1). Si l'instrument n'apparait pas dans la liste, c'est que celui n'a pas de fichier de configuration associé. Voir la partie text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epbackrun&rev=1222935666&do=diff Sélection et démarrage 1. Sélection des analyses La sélection des analyses à copier se fait soit globalement en utilisant les icônes soit analyse par analyse en sélectionnant celles désirées en début de ligne. Le nombre d’analyses sélectionnées ainsi que la taille globale estimée sont affichés en bas à droite du tableau. text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epbackvisualisation&rev=1222935666&do=diff Visualisation des analyses figure 2 : Les analyses 1. Les icônes * : Visualisation ou non des analyses non sauvegardées. L'icône affichée correspond à l'état actuel. * : Visualisation ou non des analyses déjà sauvegardées. L'icône affichée correspond à l'état actuel. text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epimsintro&rev=1222935666&do=diff Introduction Qu'est-ce que ePims ePims (pour experiment Proteomic Information Management System) est une infrastructure permettant de gérer de manière structurée les données de spectrométrie de masse issues d'une plate-forme de protéomique. Le terme text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebcreation&rev=1222935666&do=diff Création dans ePims Création d'un projet : La création d'un nouveau projet concerne la création des deux types de projets : projets rattachés à un programme et les projets orphelins: * Création d'un projet rattaché à un programme : accessible, depuis la page de description du programme, au responsable scientifique du programme en question en cliquant sur l'icône text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebentitystatus&rev=1222935666&do=diff Status des entités Sous ePims, les programmes / projets ou études peuvent avoir plusieurs états (indiqués par une icône). Le responsable d'une entité peut demander à changer l'état de son entité, en fonction du type de celle-ci et du son status actuel. Dans tous les cas, cette action est réalisée en cliquant sur l'icône appropriée (cf ci-dessous) dans la page de description de l'entité. Les icônes dites d'actions sont toujours représentées dans une toolbox. text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebftp&rev=1222935666&do=diff Récupération de données 1. Accès: (Actuellement) Seules les études ont des données accessibles. L'organisation des données relatives à une étude est données dans la page Repository ePims. Pour récupérer les données: * Accédez à la page de l'étude (voir text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebihm&rev=1222935666&do=diff Accès et organisation * Accés à ePims : http://[pims-serv]:[port]/ePims (Nota : la partie entre crochet dépend de votre installation, c'est l'adresse de la machine où à été installé le serveur Web géronimo et le port utilisé pour les connexions http. Pour plus d'informations demandez à votre administrateur réseaux). text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebplanning&rev=1222935666&do=diff Plannification Planification pour la masse a. Accès Accessible depuis le menu “Planifications > Spectromètre”. Cette page est accessible à tous mais interesse plus particulièrement les responsables instruments. b. Description Cette page permet de visualiser la liste complète de tous les échantillons en attente de passage en masse. Cette liste se décline en plusieurs tableaux représentant chacun un type d'instrument. Il est possible de sélectionner un type d'instrument pour ne visualiser… text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebprocess&rev=1222935666&do=diff Process (et Protocoles) Introduction Mise en place de la gestion et de l'organisation du système autour des process subis par le échantillons et les protocoles utilisés pour ces process. Voir le trac pour les spécifications en cours - Spécifications en cours- L'objectif est de connaître, pour un échantillon donné, l'ensemble des process qu'il a subi et plus particulèrement la dernière étape atteinte. text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:epwebsearch&rev=1222935666&do=diff Recherche 1. Activité a. Accès: Cette fonction est accessible depuis le menu “Rechercher > Activité”. b. Description : Recherche de tous les programmes et/ou projets et/ou études en saisissant un ou plusieurs des critères suivants : * text/html 2008-10-02T10:21:06+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://biodev.extra.cea.fr/docs/epims/doku.php?id=wiki:epims4_0m1:user:start&rev=1222935666&do=diff Guide d'utilisation d'ePims 4.0 * ePimsIntro * Fonctionnalités * Guide d'utilisation d'eP-Web * ePWebIHM * Fonctionnalités * Visualisation * Activité Générale * D'un Programme/Projet * D'une Etude * Mon Activité * Mes Echantillons * ePWebEntityStatus * ePWebSearch * ePWebProcess * ePWebPlanning * pour la masse * pour le robot * eP-Plate * ePWebFTP * ePWebCreation * Guide d'utilisation d'eP…