ePims

(Actuellement) Seules les études ont des données accessibles. L'organisation des données relatives à une étude est données dans la peg repository_epims.

Pour récupérer les données:

1. Accédez à la page de description complète de l'étude (voir visualisation). Cliquez sur l'icône qui se trouve à droite dans la barre d'icônes. Une nouvelle fenêtre s'ouvre dans laquelle deux arborescences sont affichées. Si ce n'est pas le cas, c'est qu'il vous manque un composant Java… faites-en part aux administrateurs du système pour y remédier.
2. Dans l'arborescence de gauche, vous pouvez sélectionner le répertoire, sur votre PC, dans lequel seront copiées les données. Sélectionnez dans la partie de droite, le(s) fichier(s) que vous souhaitez récupérer. Dans le cas des raw, sélectionnez le répertoire xxx.raw mais ne vous déplacez pas dans le répertoire sinon seule une partie des données sera récupérée. Pour lancer la copie, cliquez sur la double-flèche située entre les deux arborescences. Dans l'exemple ci-dessous, les raw des analyses LCU5858, UF_ESSILA_0280 et UF_ESSILA_0285 seront copiés dans le répertoire c:\temp.

Les données électroniques sont organisées (dans différents “repository”) par étude sur l'espace disque. Pour chaque étude on retrouve l'organisation suivante :

• raw : contient les données brutes générées par les instruments (.raw pour les QTOF par exemple).
  • spectra : contient les spectres processés issus des données brutes (.pkl ou prp par exemple)
  • results : contient les résultats d'analyses expertisés, dans un format libre
  • samples : contient les informations relatives aux échantillons
    • forms: contient les fiches échantillons fournies pour les échantillons réceptionnés
    • scans : contient des images de gels d'où sont extraits les échantillons.
    • annotation : contient les fichiers permettant d'identifier les différents échantillons extraits d'un gel 2D et de faire correspondre les nomenclatures clients et plate-forme.
  • search : contient les résultats d'identification bruts tels que produit par le logiciel utilisé.
  • analysis_request : contient les fiches d'analyses reçues dans le cadre de l'étude
  • other : …

(Continuez vers la suite de la documentation ⇒ epwebentityaction)