Actuellement, les formats de données reconnus par eP-Back sont les suivants :

• Waters
  • QTOF [Ultima] (Dans intruments.xml d'eP-Back, spécifier 'QTOF Waters')

• Thermo (Dans intruments.xml d'eP-Back, spécifier 'LTQ Thermo')
  • LTQ
  • LTQ-FT
  • OrbiTrap

Pour les données Thermo, l'accès aux informations se fait en utilisant les dll fournis par Thermo. Par conséquence, il est nécessaire d'installer sur la même machine qu'eP-Back, le logiciel XCalibur (? Avec le XDK… à confirmer ! ?)

• Applied
  • QTrap 4000 (Dans intruments.xml d'eP-Back, spécifier 'QTrap Applied')
  • Maldi ToF-ToF 4800(Dans intruments.xml d'eP-Back, spécifier 'Maldi 4800 Applied')