ePims (pour experiment Proteomic Information Management System) est une infrastructure permettant de gérer de manière structurée les données de spectrométrie de masse issues d'une plate-forme de protéomique. Le terme “infrastructure” réfère au fait que ePims n'est pas un simple outil mais plutôt un environnement informatique composé d'une suite d'outils qui, conjointement utilisés, permettent de gérer les données de la plate-forme. Cette page décrit plus en détail l'architecture de cette infrastructure.
Les principales fonctionnalités d'ePims sont les suivantes :
Organisation de l'activité de la plate-forme
Organisation hiérarchique en programmes de recherche, projets scientifiques et études
Possibilité pour chaque utilisateur de créer de nouvelles études pour les projets dont il a la charge ou dont il est membre.
Recherche multi-critère
Données électroniques résultant des acquisitions (raw data)
Transfert des données des instruments vers une zone de dépôt
Suppression sécurisée des acquisitions après leur transfert
Organisation des données en fonction de l'étude auxquelles elles appartiennent
Accès aux données par les utilisateurs du système pour un transfert vers leur poste de travail
Gestion des échantillons
Enregistrement et identification des échantillons biologiques avant la préparation par le robot
Suivi et gestion des process subis par les échantillons : Demande de préparation robot ou de passage en masse pour le moment.
Maintien du lien entre échantillon, acquisition et spectres.
Planification
Visualisation et modification des demandes réalisées (masse ou robot) par l'utilisateur
Accès, par les responsables instruments, à l'ensemble des demandes qui ont été réalisés
Génération, via une application annexe (eP-Plate), des plans de plaque pour le robot de préparation
Archivage
Génération d'états de sortie rendant compte de l'activité de la plate-forme
Accès sécurisé
(Continuez vers la suite de la documentation ⇒ epwebihm)