Thermo
Cette configuration a été testée pour
- LTQ
- LTQ-FT
- OrbiTrap
Dans la sample-list de l'instrument, utiliser les colonnes suivantes (au besoin faire apparaitre ces colonnes dans l'affichage via le menu Change → Column Arrangement de la page Sequence Setup). Il faut également ajouter des colonnes supplémentaires dans la sample-list d'XCalibur via l'icone User Labels de la page Sequence Setup. Les colonnes à ajouter sont (ATTENTION : bien respecter l'ordre dans lequel ces colonnes sont ajoutées) :
- dans
Heading 1: Operator
Au final le contenu des colonnes doit être :
File Name contient le nom de l'acquisition (ce nom sera également celui du fichier résultat d'acquisition généré par XCalibur)- Sample Name contient le nom ePims de l'échantillon
- Sample Description
A vérifier : contient la description de l'acquisition. - Operator contient le nom de l'opérateur de l'instrument
La date, la durée et la taille de l'acquisition sont obtenues automatiquement depuis le raw file. Les seuls fichiers associés possible sont les spectres processés (au format mgf) et doivent avoir le même nom que l'acquisition. Ces spectres sont localisés dans un sous-répertoire 'dta' à celui contenant les raw files.