Formatage de données des spectrométres

eP-Back se charge de transférer les fichier résultats d'acquisition dans le repository d'ePims et enregistre dans le système les acquisitions. Pour se faire, eP-Back liste les acquisitions qui se trouvent sur les fichiers résultats sur le disque de l'instrument (voir eP-Back) et pour chaque acquisition, tente de déterminer les informations suivantes :

Le nom de l'acquisition : le résultat de l'analyse sur l'instrument d'un unique échantillon. Ce nom est unique pour chaque instrument. Si on génère un fichier pour chaque acquisition, alors le nom du fichier peut être utilisé comme nom d'acquisition.
Le nom ePims de l'échantillon qui a été analysé.
Le nom de l'opérateur qui a réalisé l'analyse sur l'instrument. Ce nom doit correspondre au login utilisé dans ePims.
La date de l'acquisition
La durée de l'acquisition
La description de l'acquisition
Le type de l'acquisition : Peut être soit un controle (LC ou Instrument) soit un blanc soit une recherche
Le fichier résultat d'acquisition associé,
La taille du fichier résultat d'acquisition
les fichiers associés c'est-à-dire les spectres processés.

Les informations précédée de sont absolument requise pour que eP-Back puisse transférer les données. Si eP-Back ne parvient pas à les retrouver, vous devrez les rentrer manuellement pour chaque analyse dans l'interface utilisateur d'eP-Back (voir ePBack).

Type de l'acquisition

Pour qu'eP-Back puisse déterminer automatiquement le type de l'acquisition, le nom de l'échantillon ePims peut contenir des valeurs clés :

blanc : acquisition d'un blanc,
controleLC : acquisition destinée à contrôler le bon fonctionnement de la chromatographie
controleInst : acquisition destinée à contrôler le bon fonctionnement de l'instrument
test : acquisition de test, sans intérêt particulier.

Sample list

Si certaines de ces informations sont retrouvées automatiquement d'autres doivent être saisies par l'opérateur de l'instrument dans certains champs de la sample-liste de sorte qu'elles apparaissent dans le fichier résultat d'acquisition au moment où celui-ci est généré par l'instrument. Les champs utilisés dans la sample-list étant spécifiques à chaque instrument, les paragraphes suivants décrivent ce que doivent contenir les sample-list des instruments supportés par ePims pour qu'eP-Back puisse retrouver automatiquement ces informations.

Ces informations ont un impact sur le statut associé aux acquisitions, voir la documentation d'eP-Back

Les constructeurs supportés sont :