Le système ePims s'articule en 3 modules :

1. eP-Back qui est l'application chargée spécifiquement du transfert des données résultant des acquistions et de la suppression de ces données sur les disques des machines d'acquisition.
2. eP-Web qui est l'application web qui permet l'ensemble des autres opérations (création des études, des échantillons, archivage, états de sortie, recherche, planification, …)
3. Un serveur FTP supportant l'authentification depuis une base de données pour le transfert des données vers les postes utilisateurs.

Lors du transfert des données de la plate-forme sur un espace disque dédié, des informations relatives à ces données sont également enregistrées dans la base de données ePims. Toutes les informations recueillies sont présentées aux utilisateurs par l'intermédiaire de l'application eP-Web. De plus, les données électroniques peuvent êtres copiées sur les PCs utilisateurs en FTP, toujours par l'intermédiaire de eP-Web.

Les données électroniques sont organisées (dans différents “repository”) par étude sur l'espace disque. Pour chaque étude on retrouve l'organisation suivante :

• raw : contient les données brutes générées par les instruments (.raw pour les QTOF par exemple).
  • spectra : contient les spectres processés issus des données brutes (.pkl ou prp par exemple)
  • results : contient les résultats d'analyses expertisés, dans un format libre
  • samples : contient les informations relatives aux échantillons
    • forms: contient les fiches échantillons fournies pour les échantillons réceptionnés
    • scans : contient des images de gels d'où sont extraits les échantillons.
    • annotation : contient les fichiers permettant d'identifier les différents échantillons extraits d'un gel 2D et de faire correspondre les nomenclatures clients et plate-forme.
  • search : contient les résultats d'identification bruts tels que produit par le logiciel utilisé.
  • analysis_request : contient les fiches d'analyses reçues dans le cadre de l'étude
  • other : …