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wiki:epims4_1m1:admin:updatedbepims

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wiki:epims4_1m1:admin:updatedbepims [2009/11/16 11:08]
132.168.73.9
wiki:epims4_1m1:admin:updatedbepims [2011/03/23 09:46] (current)
132.168.72.130
Line 95: Line 95:
  
 ==== Pour le passage en version 7 de la BD ==== ==== Pour le passage en version 7 de la BD ====
-Executer la commande "​CREATE LANGUAGE plpgsql;"​ (en tant que superUser) ​avant l'​execution de ce script+**Avant** l'​exécution du script Data_migration-7.sql : 
-Penser à repasser en +  * Executer la commande "​CREATE LANGUAGE plpgsql;"​ (en tant que superUser). 
 +  ​* ​Penser à repasser en **user pims_db_user** (cf. chapitre [[configuration#​creation_de_l_utilisateur_epims|Config postgresql]]).
  
-===== Migration ​d'un répertoire racine d'​ePims ​(uniquement pour une version précédente à 4.0RC1!)=====+===== Migration ​du PIMS_ROOT ​(uniquement pour une migration d'une version précédente à 4.0RC1!) =====
 Pour la version 4.0 (à partir de la 4.0RC1) le répertoire de données d'​ePims à subit une modification dans sa structure (par exemple les fichiers de données de spectroscopie ne sont plus contenu dans les dossier //​[étude]/​raw//​ mais dans //​[étude]/​samples/​data/​RAW//​). Pour la version 4.0 (à partir de la 4.0RC1) le répertoire de données d'​ePims à subit une modification dans sa structure (par exemple les fichiers de données de spectroscopie ne sont plus contenu dans les dossier //​[étude]/​raw//​ mais dans //​[étude]/​samples/​data/​RAW//​).
 Afin de faire migrer le répertoire dans la bonne structure un programme a été créé : ePimsRoot-pre4.0-migration.jar . Afin de faire migrer le répertoire dans la bonne structure un programme a été créé : ePimsRoot-pre4.0-migration.jar .
Line 172: Line 173:
 PROPERTY2=VALUE2 PROPERTY2=VALUE2
 etc...</​code>​ etc...</​code>​
 +
 +
 +===== Changement de localisation du PIMS_ROOT =====
 +
 +  -  Arrêter eP-Back et l'​application web d'​ePims (Console d'​Apache Geronimo => Application EARs => ePims => Stop)
 +  - Pour eP-Back
 +    - Aller dans le dossier /conf dans le dossier où est installé eP-Back
 +    - Editer le fichier eP-Back.properties
 +    - Modifier la valeur attribuée à "​epims.root"​ pour mettre le chemin vers le nouvel emplacement
 +  - Pour eP-Core
 +    - Récupérer les fichiers d'​install d'​ePims (ceux déjà utilisés ou une installation nouvellement téléchargée correspondant à votre version d'​ePims). Aller dans le répertoire /eP-Core et localiser les fichiers ePCore.properties et updateJar-Core.bat (si vous êtes sous windows) ou  updateJar-Core.sh (si vous êtes sous Linux)
 +    - Copier ces 2 fichiers dans le répertoire /<​install d'​Apache Geronimo>/​repository/​lib/​eP-Core/<​version>/​ (<​version>​ est de la forme 3.7.1, prendre la version utilisée par votre version d'​ePims,​ généralement la version la plus haute présente).
 +    - Dans le répertoire cité ci-dessus (3/II/), éditer le fichier ePCore.properties
 +    - Modifier la valeur attribuée à "​PIMS_ROOT"​ pour mettre le chemin vers le nouvel emplacement
 +    - :!: Prendre soin de vérifier les valeurs des autres variables pour voir si elles correspondent à votre système. **Si le fichier ePCore.properties provient d'une installation que vous venez de télécharger (cf 3/I/) ce n'est probablement pas le cas.**
 +    - Dans le même répertoire (3/II/), éditer le fichier updateJar.bat
 +    - Modifier la version de eP-Core-x.x.x.jar
 +    - Toujours dans le répertoire cité ci-dessus (3/II/), lancer updateJar (.bat ou .sh suivant le système d'​exploitation). Cela va mettre à jour le fichier eP-Core-<​version>​.jar avec le fichier de properties modifié
 +  - Redémarrer ePims et eP-Back
  
wiki/epims4_1m1/admin/updatedbepims.1258366137.txt.gz · Last modified: 2009/11/16 11:08 by 132.168.73.9