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   * Triple TOF mais doit également fonctionner avec les QTrap 4000-5500-6500 ...
-Ce format est compatible avec le format 'QTrap Applied' mais permet des configurations supplémentaires.
+Ce format est compatible avec le format 'QTrap Applied' mais permet des configurations supplémentaires :
+  * Il permet de supporter l'option "Use flat files for scan data" (voir ci-dessous) qui sépare une analyse en 2 fichiers, un .wiff et un .wiff.scan.
-Ce format permet de supporter l'option "Use flat files for scan data" (voir ci-dessus) qui sépare une analyse en 2 fichiers, un .wiff et un .wiff.scan.
+  * Mais il supporte aussi le cas où seul un .wiff est généré.
-Ce format supporte aussi le cas où seul un .wiff est généré.
+  * Il permet plus de souplesse dans la définition des propriétés (voir ci-dessous)
 **ATTENTION** : Si on utilise la "simplification" des champs de la Sample List/Batch, il est nécessaire de n'avoir qu'une seule acquisition par fichiers (wiff ou wiff+scan) puisque le nom de l'acquisition est déduit de celui du fichier.
-Il est toujours possible d'utiliser la définition des propriétés comme cela a été décrit pour le 'QTrap Applied'. Dans ce cas, on peut définir plusieurs acquisitions (voir le format 'QTrap Applied' ci-dessous !)
+Il est toujours possible d'utiliser la définition des propriétés comme cela a été décrit pour le 'QTrap Applied'. Dans ce cas, on peut définir plusieurs acquisitions.
 === Propriétés ===
-Dans la sample list de l'instrument l'instrument, ajouter deux colonnes supplémentaires :
+Si la colonne Sample ID est définie, on utilise
-  - **operateur** ou **operator**
+  * :!: //**Sample ID**//  contient **le nom ePims de l'échantillon**
-  - **description**
+  * :!: //**Sample Name**// contient **le nom de l'acquisition**
+  * //**Data File**// correspond au nom du **fichier résultat d'acquisition**
-Dans le batch file de l'instrument les propriétés suivantes doivent être définies :
+Dans le cas contraire les propriétés attendues
   * :!: //**Sample Name**//  contient **le nom ePims de l'échantillon**
   * :!:  //**Data File**// correspond au nom du **fichier résultat d'acquisition** et **au nom de l'acquisition** (sans extension)
-  * //**operateur**// ou //**operator**// contient le nom de l'opérateur de l'instrument.
-  * //**description**// contient **la description** de l'acquisition.
-La date et la taille de l'acquisition sont déduites du fichier wiff contenant l'acquisition. \\
+Si des colonnes supplémentaires ont été ajoutées, on attend
-Pour chaque acquisition, il est possible de créer des spectres processés, au format MGF. Ces fichiers .mgf doivent porter le même nom que l'acquisition et se trouver dans un sous répertoire //MGF// par rapport au répertoire contenant les acquisitions.
+  * la colonne //**operateur**// ou //**operator**// qui contient le nom de l'opérateur de l'instrument.
+  * la colonne //**description**// qui contient **la description** de l'acquisition.
-**Note** La durée n'est actuellement pas récupérée.
+Sinon
+  * Depuis la colonne //**comment**// est extraits
-=== Propriétés au format 'QTrap Applied' ===
+    * //**op=XXX**// où XXX est le nom de l'opérateur de l'instrument.
+    * //**d=ZZZ**// où ZZZ est **la description** de l'acquisition.
-Dans la sample list de l'instrument l'instrument, ajouter deux colonnes supplémentaires :
+  * Si op/d ne sont pas saisis
-  - **operateur** ou **operator**
+    * la colonne //**comment**// contient **la description** de l'acquisition.
-  - **description**
-Dans le batch file de l'instrument les propriétés suivantes doivent être définies :
-  * :!: //**Sample ID**//  contient **le nom ePims de l'échantillon**
-  * :!: //**Sample Name**// contient **le nom de l'acquisition**
-  * //**Data File**// correspond au nom du **fichier résultat d'acquisition**
-  * //**operateur**// ou //**operator**// contient le nom de l'opérateur de l'instrument.
-  * //**description**// contient **la description** de l'acquisition.
 La date et la taille de l'acquisition sont déduites du fichier wiff contenant l'acquisition. \\

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