wiki:epims4_0m2:user:epbackvisualisation
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| Line 4: | Line 4: | ||
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| figure 2 : Les analyses | figure 2 : Les analyses | ||
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| ==== 1. Les icônes ==== | ==== 1. Les icônes ==== | ||
| Line 17: | Line 18: | ||
| * {{.:selectInverse.png}} : Inverse la sélection : désélectionne les analyses sélectionnées et sélectionne les analyses "sélectionnables" qui ne l'étaient pas | * {{.:selectInverse.png}} : Inverse la sélection : désélectionne les analyses sélectionnées et sélectionne les analyses "sélectionnables" qui ne l'étaient pas | ||
| - | * {{.:refresh.gif}} : Recherche de nouveau les analyses dans le répertoire spécique à l'instrument | + | * {{.:refresh.gif}} : Recherche de nouveau les analyses dans le répertoire spécifique à la configuration |
| - | + | ==== 2. Les informations ==== | |
| - | ==== 2. La liste ==== | + | |
| Quelque soit le type de l'instrument sélectionné et donc le format des analyses certaines colonnes sont toujours présentes:\\ | Quelque soit le type de l'instrument sélectionné et donc le format des analyses certaines colonnes sont toujours présentes:\\ | ||
| * Le nom de l'analyse | * Le nom de l'analyse | ||
| - | * L'étude dans laquelle elle a été faite | + | * La colonne étude est toujours affichée mais n'est plus utilisée ! |
| * L'échantillon qui a été analysé | * L'échantillon qui a été analysé | ||
| * La date de l'acquisition | * La date de l'acquisition | ||
| Line 35: | Line 35: | ||
| L'état informe sur la validité des informations fournies. Les différents états possibles pour une analyse sont :\\ | L'état informe sur la validité des informations fournies. Les différents états possibles pour une analyse sont :\\ | ||
| - | * Etude invalide : le nom spécifié pour l'étude n'est pas connu de ePims | + | * ''Sauvegardée'' : l'acquisition correspondante a déjà été transférée sur le SAN |
| - | * Sauvegardée : l'acquisition correspondante a déjà été transférée sur le SAN | + | * ''Etude close'' : l'étude de rattachement de l'échantillon existe mais est close. |
| - | * Etude close : l'étude d'appartenance de l'analyse existe mais est close. | + | * ''Ech. indéfini'' : le nom spécifié pour l'échantillon n'est pas connu de ePims |
| - | * Echantillon invalide : le nom spécifié pour l'échantillon n'est pas connu de ePims | + | |
| - | * Ech <> etude : L'échantillon spécifié existe mais il est rattaché à une autre étude. | + | |
| * OK : les informations relatives à l'analyse sont cohérentes et elle n'a pas encore été sauvegardée. | * OK : les informations relatives à l'analyse sont cohérentes et elle n'a pas encore été sauvegardée. | ||
| - | L'état réel d'une analyse peut être une combinaison de ces différents états mais seul le plus "prioritaire" sera indiqué. L'ordre de priorité est celui utilisé ci-dessus. Par conséquent, pour une analyse référencant un échantillon inexistant et appartenant à une étude close, la colonne état indiquera "Etude close".\\ \\ Les acquisitions de contrôles ne sont rattachées à aucune étude ou aucun échantillon. Par conséquent leur état est soit OK, soit Sauvegardée. Pour les identifier, les valeurs ControleLC, ControleInst et Blanc doivent être saisies dans la colonne Etude pour, respectivement, les acquisitions de contrôles des LC, des spectromètres et les blancs utilisés entre deux acquisitions recherches.\\ \\ La table peut être ordonnée selon n’importe laquelle des colonnes affichées. Pour cela, il suffit de double cliquer sur l’en-tête de la colonne. \\ | + | Les acquisitions de contrôles ne sont rattachées à aucune étude ou aucun échantillon. Par conséquent leur état est soit OK, soit Sauvegardée. Pour les identifier, les valeurs ''**ControleLC**'', ''**ControleInst**'' et ''**Blanc**'' doivent être saisies dans la colonne ''Echantillon'' pour, respectivement, les acquisitions de contrôles des LC, des spectromètres et les blancs utilisés entre deux acquisitions recherches.\\ |
| + | \\ La table peut être ordonnée selon n’importe laquelle des colonnes affichées. Pour cela, il suffit de double cliquer sur l’en-tête de la colonne. \\ | ||
| - | === a. Colonnes supplémentaires === | + | === Colonnes supplémentaires === |
| Selon le type de l'instrument sélectionné et donc le format des analyses, des colonnes supplémentaires peuvent être affichées.\\ \\ Pour les QTOF Waters les colonnes suivantes sont présentes :\\ | Selon le type de l'instrument sélectionné et donc le format des analyses, des colonnes supplémentaires peuvent être affichées.\\ \\ Pour les QTOF Waters les colonnes suivantes sont présentes :\\ | ||
| - | * Le nom du responsable de l'analyse correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition | + | * Le nom du responsable instrument correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition |
| - | * Le nom du responsable de l'échantillon | + | |
| * Une description de l'analyse. | * Une description de l'analyse. | ||
| * Le pkl associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionnée dans la panneau de configuration spécifique aux QTOF Water (voir chapitre plus haut) | * Le pkl associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionnée dans la panneau de configuration spécifique aux QTOF Water (voir chapitre plus haut) | ||
| Line 56: | Line 54: | ||
| \\ Pour les LTQ Thermo les colonnes suivantes sont présentes :\\ | \\ Pour les LTQ Thermo les colonnes suivantes sont présentes :\\ | ||
| - | * Le nom du responsable de l'analyse correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition | + | * Le nom du responsable instrument correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition |
| - | * Le nom du responsable de l'échantillon | + | |
| * Une description de l'analyse. | * Une description de l'analyse. | ||
| * Le mgf associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionné dans la panneau de configuration spécifique aux LTQ Thermo (voir chapitre plus haut) | * Le mgf associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionné dans la panneau de configuration spécifique aux LTQ Thermo (voir chapitre plus haut) | ||
| + | \\ Pour le QTRAP Applied les colonnes suivantes sont présentes :\\ | ||
| - | \\ Pour les Applied les colonnes suivantes sont présentes :\\ | + | * Le nom du responsable instrument correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition |
| - | + | ||
| - | * Le nom du responsable de l'échantillon | + | |
| * Une description de l'analyse. | * Une description de l'analyse. | ||
| * le nom du fichier correspond à l'analyse | * le nom du fichier correspond à l'analyse | ||
| * Le mgf associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionné dans la panneau de configuration spécifique à l'instrument (voir chapitre plus haut) | * Le mgf associé à l'analyse si l'option transfert des spectres à été sélectionné dans la panneau de configuration spécifique à l'instrument (voir chapitre plus haut) | ||
| - | === b. Modification === | + | \\ Pour le Maldi 4800 Applied les colonnes suivantes sont présentes :\\ |
| + | * Fichier zip : permet après un transfert de savoir si la constitution du zip à été effectué sans problème ou pas. | ||
| + | * Le nom du responsable instrument correspondant à la personne ayant réalisée l'acquisition. | ||
| + | * Une description de l'analyse. | ||
| + | * le nom du fichier correspond à l'analyse. | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==== Maintien de la liste et modification ==== | ||
| + | |||
| + | === Modification du nom d'échantillon === | ||
| + | |||
| + | Lorsqu'une erreur à été commise lors du renseignement du nom de l'échantillon au moment de l'acquisition, il est possible de corriger cette valeur au niveau de eP-Back. Pour cela il suffit de double-cliquer sur la cellule du tableau contenant la valeur à corriger.\\ | ||
| + | la modification des valeurs des acquisitions déjà transférées sur le SAN n'a pas d'effet.\\ | ||
| + | De plus, il est possible de faire du copier/coller sur plusieurs cellules : sélectionner avec un simple clique la colonne à copier, taper <Ctrl>+C, sélectionner toutes les colonnes pour lesquelles on souhaite saisir la nouvelle valeur et taper <Ctrl>+v. La sélection de plusieurs colonnes se fait avec la touche <shift> et/ou <Ctrl>.\\ \\ | ||
| + | |||
| + | |||
| + | === Mise à jour === | ||
| + | |||
| + | La liste des analyses pour un instrument donné est conservée, même d'une exécution à l'autre. Ceci signifie qu'une fois qu'eP-Back a lu les informations relatives à une analyse, il ne les relira plus depuis le fichier d'acquisition mais uniquement depuis le "cache" qu'il conserve. Par conséquence, une fois que le nom de l'échantillon est modifié il est //compliqué// de revenir à la valeur initiale. \\ | ||
| + | |||
| + | Par contre, à chaque fois que l'on accède à une configuration, les informations relatives aux nouvelles analyses sont lues et celles relatives aux analyses n'existant plus sur l'espace disque dédié sont supprimées. Il est possible de forcer ce rafraîchissement de la liste en cliquant sur l'icône {{.:refresh.gif}}. | ||
| + | \\ | ||
| + | \\ | ||
| + | :!: De plus, si lorsqu'eP-back a lu les informations d'une analyse, le nom de l'échantillon n'était pas encore défini dans ePims, il sera nécessaire de modifier le nom de l'échantillon dans l'interface graphique (en remettant le même) pour qu'eP-Back fasse un rafraîchissement des informations relatives à l'analyse (status, chemin destination). | ||
| + | \\ | ||
| + | \\ | ||
| + | Dans tous les cas, si l'on souhaite réinitialiser complètement la liste des analyses pour un instrument, il est possible de supprimer le fichier <nom-config>.xml qui se trouve à la racine de l'application. | ||
| - | Lorsqu'une erreur à été commise lors du renseignement du nom de l'étude et/ou de l'échantillon au moment de l'acquisition, il est possible de corriger ces valeurs au niveau de eP-Back. Pour cela il suffit de double-cliquer sur la cellule du tableau contenant la valeur à corriger.\\ Il est impossible de modifier les valeurs des acquisitions déjà transférées sur le SAN.\\ \\ De plus, il est possible de faire du copier/coller sur plusieurs cellules : sélectionner avec un simple clique la colonne à copier, taper <Ctrl>+C, sélectionner toutes les colonnes pour lesquelles on souhaite saisir la nouvelle valeur et taper <Ctrl>+v. La sélection de plusieurs colonnes se fait avec la touche <shift> et/ou <Ctrl>.\\ \\ | ||
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