wiki:epims4_0m2:developer:epbackformatspecificity
Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
| Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision | ||
|
wiki:epims4_0m2:developer:epbackformatspecificity [2008/08/25 15:22] barthe |
wiki:epims4_0m2:developer:epbackformatspecificity [2008/10/02 10:21] (current) |
||
|---|---|---|---|
| Line 14: | Line 14: | ||
| ==== Listing des analyses ==== | ==== Listing des analyses ==== | ||
| - | Fait a partir du fichier XML de description du spotset. La technologie utilisé est SAX (l'implémentation étant [[http://xerces.apache.org/xerces2-j/|Xerces]]). Ce listing est lancé par le CacheManager qui appelle la fabrique spécifique au 4800 : //Maldi4800Factory//. Cette fabrique délègue le listing au //Maldi4800XMLParser// car, la technologie SAX étant utilisé pour parser le fichier XML, la classe qui l'utilise doit étendre //DefaultHandler// pour attraper les évènements SAX. Le parser a la structure suivante : | + | - Fait a partir du fichier XML de description du spotset. La technologie utilisé est SAX (l'implémentation étant [[http://xerces.apache.org/xerces2-j/|Xerces]]). Ce listing est lancé par le CacheManager qui appelle la fabrique spécifique au 4800 : //Maldi4800Factory//. Cette fabrique délègue le listing au //Maldi4800XMLParser// car, la technologie SAX étant utilisé pour parser le fichier XML, la classe qui l'utilise doit étendre //DefaultHandler// pour attraper les évènements SAX. Le parser a la structure suivante : |
| * Une méthode d'initialisation et de démarrage du parsing : //extractAnalysis(File file, Maldi4800Format format)//. Méthode appelé par la fabrique. | * Une méthode d'initialisation et de démarrage du parsing : //extractAnalysis(File file, Maldi4800Format format)//. Méthode appelé par la fabrique. | ||
| * Les méthodes de capture des évènements SAX qui ont pour but de compléter la liste d'analyse (=//analysisList//) : //startElement(...)// et //endElement(...)// qui sont appelé respectivement quand le parsing rencontre une balise ouvrante et une balise fermante. Les traitements effectués vont varier suivant le nom de la balise rencontrée (=//qName//) et, pour les balises ouvrantes, vont dépendre/prendre en compte les attributs de cette balise (=//attributes//). | * Les méthodes de capture des évènements SAX qui ont pour but de compléter la liste d'analyse (=//analysisList//) : //startElement(...)// et //endElement(...)// qui sont appelé respectivement quand le parsing rencontre une balise ouvrante et une balise fermante. Les traitements effectués vont varier suivant le nom de la balise rencontrée (=//qName//) et, pour les balises ouvrantes, vont dépendre/prendre en compte les attributs de cette balise (=//attributes//). | ||
| Line 21: | Line 21: | ||
| * //getDateFromAttribute// : création d'une //Date// à partir du format utilisé dans les xml créé par le logiciel 4000 Series Explorer. | * //getDateFromAttribute// : création d'une //Date// à partir du format utilisé dans les xml créé par le logiciel 4000 Series Explorer. | ||
| - | + | \\ | |
| - | Le listing des analyses suit le workflow suivant : | + | \\ |
| + | - Le listing des analyses suit le workflow suivant : | ||
| * Récupération du nom du spotset | * Récupération du nom du spotset | ||
wiki/epims4_0m2/developer/epbackformatspecificity.1219670564.txt.gz · Last modified: 2008/09/24 15:35 (external edit)
Page Tools
Except where otherwise noted, content on this wiki is licensed under the following license: CC Attribution-Share Alike 4.0 International
