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wiki:epims4_0m2:admin:rawdata [2008/08/21 17:28] barthe |
wiki:epims4_0m2:admin:rawdata [2008/10/23 09:12] (current) 132.168.73.9 |
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Line 109: | Line 109: | ||
- | ==== 4800 MALDI ToF-ToF ==== | ||
- | [[4800Applied]] | ||
+ | ==== MALDI ToF-ToF ==== | ||
+ | Cette configuration a été testée pour :\\ | ||
+ | - 4800 Maldi ToF-Tof | ||
+ | |||
+ | * :!: Dans le spotset mettre dans la colonne "name" de chaque spot **le nom de l'échantillon ePims** auquel correspond celui-ci (pour plus de rapidité le nom peut être rentré une seule fois et étendu à tout les autres spot correspondant au même échantillon). | ||
+ | * Une fois les acquisitions effectuées, extraire : | ||
+ | - dans le dossier **[source]**((Le dossier défini dans la balise //<src>// du fichier de configuration //instrument.xml//))**/spotsets/** : le fichier de description du spotset et des méthodes d'analyse. Pour ce faire : File -> Export XML from database -> ajouter le spotset et les méthodes voulues -> Export. | ||
+ | - dans le dossier **[source]/spotsets/t2d/** : les fichiers de données. Pour ce faire, sélectionnez les spots dans la fenêtre de description du spotset -> clique droit -> Export data. | ||
+ | |||
+ | - Nota : | ||
+ | * Le nom des analyses est construit tel que suit : [nom du spotset]-[numéro du run]-[nom de l'échantillon spécifié dans 4000SE]. Exemple : Fi_20080506-5-Ech01. | ||
+ | * Les différents fichiers concernant une analyse (description du spotset et fichiers de données t2d) sont rassemblés dans un fichier zip par eP-Back avant d'être transférés. Ce fichier zip aura pour nom celui de l'analyse. | ||
+ | * [[4800Applied]] |