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|---|---|---|---|
| Line 67: | Line 67: | ||
| La date, la durée et la taille de l'acquisition sont obtenues automatiquement depuis le raw file. Les seuls fichiers associés possible sont les spectres processés (au format mgf) et doivent avoir le même nom que l'acquisition. Ces spectres sont localisés dans un sous-répertoire 'dta' à celui contenant les raw files. | La date, la durée et la taille de l'acquisition sont obtenues automatiquement depuis le raw file. Les seuls fichiers associés possible sont les spectres processés (au format mgf) et doivent avoir le même nom que l'acquisition. Ces spectres sont localisés dans un sous-répertoire 'dta' à celui contenant les raw files. | ||
| + | |||
| Line 72: | Line 73: | ||
| ===== Applied Biosystems ===== | ===== Applied Biosystems ===== | ||
| + | ==== Fichiers WIFF ==== | ||
| Cette configuration a été testée pour | Cette configuration a été testée pour | ||
| * QTrap 4000 | * QTrap 4000 | ||
| Line 108: | Line 110: | ||
| + | |||
| + | ==== MALDI ToF-ToF ==== | ||
| + | |||
| + | Cette configuration a été testée pour :\\ | ||
| + | - 4800 Maldi ToF-Tof | ||
| + | |||
| + | * :!: Dans le spotset mettre dans la colonne "name" de chaque spot **le nom de l'échantillon ePims** auquel correspond celui-ci (pour plus de rapidité le nom peut être rentré une seule fois et étendu à tout les autres spot correspondant au même échantillon). | ||
| + | * Une fois les acquisitions effectuées, extraire : | ||
| + | - dans le dossier **[source]**((Le dossier défini dans la balise //<src>// du fichier de configuration //instrument.xml//))**/spotsets/** : le fichier de description du spotset et des méthodes d'analyse. Pour ce faire : File -> Export XML from database -> ajouter le spotset et les méthodes voulues -> Export. | ||
| + | - dans le dossier **[source]/spotsets/t2d/** : les fichiers de données. Pour ce faire, sélectionnez les spots dans la fenêtre de description du spotset -> clique droit -> Export data. | ||
| + | |||
| + | - Nota : | ||
| + | * Le nom des analyses est construit tel que suit : [nom du spotset]-[numéro du run]-[nom de l'échantillon spécifié dans 4000SE]. Exemple : Fi_20080506-5-Ech01. | ||
| + | * Les différents fichiers concernant une analyse (description du spotset et fichiers de données t2d) sont rassemblés dans un fichier zip par eP-Back avant d'être transférés. Ce fichier zip aura pour nom celui de l'analyse. | ||
| + | * [[4800Applied]] | ||
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