wiki:epims4_0m1:user:epwebprocess
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wiki:epims4_0m1:user:epwebprocess [2008/06/16 09:45] dupierris |
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| Line 53: | Line 53: | ||
| == Sélection == | == Sélection == | ||
| - | Dans tous les cas, pour changer manuellement la dernière étape associée à des échantillons, il faut **sélectionner** les échantillons concernés dans le tableau des échantillons du process courant et **cliquer** sur l'icône {{.:epw_select_samples.png}} afin de les ajouter à la sélection dans la partie droite de la page (cf illustration ci-dessous). Il est possible de parcourir plusieurs pages du tableau afin de créer la sélection mais les échantillons ne peuvent pas être issus de d'"étapes" différentes. En effet, les changements d'étapes sont soumis à des vérifications qui deviennent complexes si les échantillons ne sont pas dans un même //état.// | + | Dans tous les cas, pour changer manuellement la dernière étape associée à des échantillons, il faut **sélectionner** les échantillons concernés dans le tableau et **cliquer** sur l'icône {{.:epw_select_samples.png}} afin de les ajouter à la sélection finale dans la partie droite de la page (cf illustration ci-dessous).\\ |
| + | Il est possible de parcourir plusieurs pages du tableau afin de créer la sélection mais les échantillons ne peuvent pas être issus de différentes étapes. En effet, les changements d'étapes sont soumis à des vérifications qui deviennent complexes si les échantillons ne sont pas dans un même //état.// | ||
| {{.:epw_study_process_selection.png|}} | {{.:epw_study_process_selection.png|}} | ||
| Line 64: | Line 65: | ||
| - La demande en masse ou en robot est décrite ci-dessous : | - La demande en masse ou en robot est décrite ci-dessous : | ||
| * sélecionner les échantillons concernés (cf. chapitre précédent) | * sélecionner les échantillons concernés (cf. chapitre précédent) | ||
| - | * cliquer sur ''Changer étape'', la fenêtre suivante apparait. | + | * cliquer sur ''Changer étape'', une nouvelle fenêtre apparait (voir ci-dessous). |
| + | * dans le menu déroulant en en-tête, sélectionner l'étape à définir. Actuellement seul les ''Requête Masse'' et ''Requête Robot'' sont fonctionnelles. | ||
| + | * Il est possible (mais pas obligatoire) d'utiliser le template. Pour cela il faut saisir les paramètres communs dans la partie haute de la fenêtre et cliquer sur ''Appliquer''. | ||
| + | * Les valeurs pour chaque échantillon sont à saisir (ou peuvent être modifiées dans le cas de l'utilisation du template) dans le tableau du bas. Une fois que les valeurs correctes, valider en cliquant sur ''Appliquer''. | ||
| + | * La vue Process de l'étude est de nouveau affichée et les échantillons ont été déplacés dans le tableau correspondant au nouveau process. | ||
| - | {{.:epw_new_process_1.png|}} | + | {{.:epw_new_process.png|}} |
| - | + | ||
| - | * dans le menu déroulant en en-tête, sélectionner l'étape à définir. Actuellement seul les ''Requête Masse'' et ''Requête Robot'' sont fonctionnelles. | + | |
| - | * Il est possible (mais pas obligatoire) d'utiliser le template. Pour cela il faut saisir les paramètres communs dans la partie haute de la fenêtre et cliquer sur Appliquer. | + | |
| - | * Les valeurs pour chaque échantillon sont à saisir (ou peuvent être modifiées dans le cas de l'utilisation du template) dans le tableau du bas. Une fois que les valeurs correctes, valider en cliquant sur ''Applique''. | + | |
| - | * La vue Process de l'étude est de nouveau affichée et les échantillons ont été déplacés dans le tableau correspondant au nouveau process. | + | |
| - | Un descriptif est donné pour plusieurs paramètres, pour le visualiser, passer la souris sur l'icône d'aide {{.: | + | Un descriptif est donné pour les paramètres, pour le visualiser passer la souris sur l'icône d'aide {{.:epw_help.png}} |
| - | Pour la requête masse, les paramètres à saisir sont : | + | \\ |
| + | \\ | ||
| + | Pour la **requête masse**, les paramètres à saisir sont : | ||
| * le type d'instrument sur lequel on souhaite faire passer les échantillons. Ceci permet de choisir non pas l'instrument spécifiquement mais le modèle. Si le laboratoire est équipé de deux QTOF, Q1 et Q2, et d'un LTQ-FT, FT1, le choix se fera entre QTOF et LTQ-FT. Ce sont donc les caractéristiques des instruments qui sont choisies ici. | * le type d'instrument sur lequel on souhaite faire passer les échantillons. Ceci permet de choisir non pas l'instrument spécifiquement mais le modèle. Si le laboratoire est équipé de deux QTOF, Q1 et Q2, et d'un LTQ-FT, FT1, le choix se fera entre QTOF et LTQ-FT. Ce sont donc les caractéristiques des instruments qui sont choisies ici. | ||
| - | * le nombre d'injection à réaliser avec l'échantillon (correspond à un nombre d'acquisitions à réaliser) | + | * le nombre d'injections à réaliser avec l'échantillon (correspond à un nombre d'acquisitions à réaliser) |
| * Commentaire : toute information pouvant être utile au responsable instrument pour l'acquisition | * Commentaire : toute information pouvant être utile au responsable instrument pour l'acquisition | ||
| - | + | \\ | |
| - | Pour la requête robot, les paramètres à saisir sont : | + | Pour la **requête robot**, les paramètres à saisir sont : |
| * le load count : permet de spécifier le nombre de puits dans lesquels l'échantillon devra être splitté (à ne spécifier qu'en connaissance de cause). ceci n'est pas un aliquotage, l'échantillon sera repoolé à la fin de la préparation. | * le load count : permet de spécifier le nombre de puits dans lesquels l'échantillon devra être splitté (à ne spécifier qu'en connaissance de cause). ceci n'est pas un aliquotage, l'échantillon sera repoolé à la fin de la préparation. | ||
| * Quantité de trypsine / Quantité de protéine : Une seule de ces informations est nécessaire. Elle permet de connaître la complexité de l'échantillon et de déterminer la quantité de trypsine nécessaire à la digestion. Pour les expert, la quantité de trypsine pourra être directement saisie. | * Quantité de trypsine / Quantité de protéine : Une seule de ces informations est nécessaire. Elle permet de connaître la complexité de l'échantillon et de déterminer la quantité de trypsine nécessaire à la digestion. Pour les expert, la quantité de trypsine pourra être directement saisie. | ||
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