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wiki:epims4_0m1:user:epwebprocess

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wiki:epims4_0m1:user:epwebprocess [2008/06/13 16:39]
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   - à l'​ajout d'un process ou d'une demande   - à l'​ajout d'un process ou d'une demande
   - à la suppression d'une demande (reviens à l'​état précédent)   - à la suppression d'une demande (reviens à l'​état précédent)
-  ​+ 
 +== Sélection == 
 +Dans tous les cas, pour changer manuellement la dernière étape associée à des échantillons,​ il faut **sélectionner** les échantillons concernés dans le tableau et **cliquer** sur l'​icône {{.:​epw_select_samples.png}} afin de les ajouter à la sélection finale dans la partie droite de la page (cf illustration ci-dessous).\\ 
 +Il est possible de parcourir plusieurs pages du tableau afin de créer la sélection mais les échantillons ne peuvent pas être issus de différentes étapes. En effet, les changements d'​étapes sont soumis à des vérifications qui deviennent complexes si les échantillons ne sont pas dans un même //​état.//​ 
 + 
 +{{.:​epw_study_process_selection.png|}} 
 + 
 +== Règles et actions == 
 + 
 +  - Lorsque des échantillons sont en attente de passage en masse (''​Requête Masse''​) ou de passage sur le robot de préparation (''​Requête Robot''​),​ la seule action (manuelle) possible est de les supprimer de la demande. Pour cela, sélectionner les échantillons (cf. chapitre prcédent) et cliquer sur ''​Supp. de la demande''​. 
 +  - Le changement de ''​Requête Masse''​ en ''​Masse''​ se fait automatiquement lors du transfert (ou plus précisément de l'​enregistrement) de l'​acquisition correspond à l'​échantillon. 
 +  - Le changement de ''​Requête Robot''​ en ''​Run Robot''​ se fait automatiquement lors de la validation de la plaque robot contenant l'​échantillon concerné. 
 +  - La demande en masse ou en robot est décrite ci-dessous :  
 +    * sélecionner les échantillons concernés (cf. chapitre précédent) 
 +    * cliquer sur ''​Changer étape'',​ une nouvelle fenêtre apparait (voir ci-dessous).  
 +    * dans le menu déroulant en en-tête, sélectionner l'​étape à définir. Actuellement seul les ''​Requête Masse''​ et ''​Requête Robot''​ sont fonctionnelles. 
 +    * Il est possible (mais pas obligatoire) d'​utiliser le template. Pour cela il faut saisir les paramètres communs dans la partie haute de la fenêtre et cliquer sur ''​Appliquer''​. 
 +    * Les valeurs pour chaque échantillon sont à saisir (ou peuvent être modifiées dans le cas de l'​utilisation du template) dans le tableau du bas. Une fois que les valeurs correctes, valider en cliquant sur ''​Appliquer''​. 
 +    * La vue Process de l'​étude est de nouveau affichée et les échantillons ont été déplacés dans le tableau correspondant au nouveau process. 
 + 
 +{{.:​epw_new_process.png|}} 
 + 
 +Un descriptif est donné pour les paramètres,​ pour le visualiser passer la souris sur l'​icône d'aide {{.:​epw_help.png}} 
 +\\ 
 +\\ 
 +Pour la **requête masse**, les paramètres à saisir sont : 
 +  * le type d'​instrument sur lequel on souhaite faire passer les échantillons. Ceci permet de choisir non pas l'​instrument spécifiquement mais le modèle. Si le laboratoire est équipé de deux QTOF, Q1 et Q2, et d'un LTQ-FT, FT1, le choix se fera entre QTOF et LTQ-FT. Ce sont donc les caractéristiques des instruments qui sont choisies ici. 
 +  * le nombre d'​injections à réaliser avec l'​échantillon (correspond à un nombre d'​acquisitions à réaliser) 
 +  * Commentaire : toute information pouvant être utile au responsable instrument pour l'​acquisition 
 + 
 +\\ 
 +Pour la **requête robot**, les paramètres à saisir sont : 
 +  * le load count : permet de spécifier le nombre de puits dans lesquels l'​échantillon devra être splitté (à ne spécifier qu'en connaissance de cause). ceci n'est pas un aliquotage, l'​échantillon sera repoolé à la fin de la préparation. 
 +  * Quantité de trypsine / Quantité de protéine : Une seule de ces informations est nécessaire. Elle permet de connaître la complexité de l'​échantillon et de déterminer la quantité de trypsine nécessaire à la digestion. Pour les expert, la quantité de trypsine pourra être directement saisie. 
 +  * Type de séparation. Specifie le type de séparation dont est issu l'​échantillon. De même que pour la quantité de protéine, cette information permet de connaître la complexité de l'​échantillon. 
 +  * Commentaire : toute information pouvant être utile au responsable robot 
 + 
 + 
  
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