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bruley
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-===== Architecture =====
+===== Infrastructure d'ePims =====
-==== fonctionnelle ====
-Le système ePims s'articule en 3 modules :
-  - **eP-Back** qui est l'application chargée spécifiquement du transfert des données résultant des acquistions et de la suppression de ces données sur les disques des machines d'acquisition.
+Du point de vue de l'utilisateurn, le système ePims s'articule en 3 modules :
-  - **eP-Web** qui est  l'application web qui permet l'ensemble des autres opérations (création des études, des échantillons, archivage, états de sortie, recherche, planification, ...)
-  - Un **serveur FTP** supportant l'authentification depuis une base de données pour le transfert des données vers les postes utilisateurs.
-{{ archi.png }}
+  - **eP-Back** est l'application chargée du transfert des données résultant des acquisitions vers le repository de données d'ePims et de la suppression de ces données sur les disques des machines d'acquisition.
+  - **eP-Web** est l'application web qui permet aux utilisateurs de réaliser l'ensemble des opérations courantes de gestion de leurs échantillons : création des études, des échantillons, archivage, états de sortie, recherche, planification, ... Depuis ce module, l'utilisateur peut également accéder à l'application **eP-Plate** qui permet de créer, d'enregistrer et de modifier les plaques 96 puits du robot de préparation des échantillons.
+  - Le **serveur FTP** permet à chaque urilisateur de re-transferer sur son poste les données qui se trouvent sur le repository ePims.
-Lors du transfert des données de la plate-forme sur un espace disque dédié, des informations relatives à ces données sont également enregistrées dans la base de données ePims. Toutes les informations recueillies sont présentées aux utilisateurs par l'intermédiaire de l'application eP-Web. De plus, les données électroniques peuvent êtres copiées sur les PCs utilisateurs en FTP, toujours par l'intermédiaire de eP-Web.
+{{ archi_user.png }}
-Les données électroniques sont organisées (dans différents "repository") par étude sur l'espace disque. Pour chaque étude on retrouve l'organisation suivante :
+Ces modules utilisent principalement deux ressources :
-    * **raw** : contient les données brutes générées par les instruments (.raw pour les QTOF par exemple).
+  - **Repository ePims** : les données d'acquisition sont transferées sur un espace disque dédié, des informations relatives à ces données sont également enregistrées dans la base de données ePims. Toutes les informations recueillies sont présentées aux utilisateurs par l'intermédiaire de l'application eP-Web. De plus, les données électroniques peuvent êtres copiées sur les PCs utilisateurs en FTP, toujours par l'intermédiaire de eP-Web.
-      * **spectra** : contient les spectres processés issus des données brutes (.pkl ou prp par exemple)
+  - **La base de données ePims**
-      * **results** : contient les résultats d'analyses expertisés, dans un format libre
-      * **samples** :  contient les informations relatives aux échantillons
-         * **forms**: contient les fiches échantillons fournies pour les échantillons réceptionnés
-         * **scans** : contient des images de gels d'où sont extraits les échantillons.
-         * **annotation** : contient les fichiers permettant d'identifier les différents échantillons extraits d'un gel 2D et de faire correspondre les nomenclatures clients et plate-forme.
-      * **search ** : contient les résultats d'identification bruts tels que produit par le logiciel utilisé.
-      * **analysis_request** : contient les fiches d'analyses reçues dans le cadre de l'étude
-      * **other** : ...
-==== détaillée ====
-D'un point de vue administration (et développement...), le système ePims est en fait plus complet que ce qui est décrit ci-dessus. ePims est une application J2EE composée des modules suivants :
-  * **eP-Web** : l'application web qui permet l'ensemble des opérations de gestion de l'activité (création des études, des échantillons, archivage, états de sortie, recherche, planification, ...)
-  * **eP-WebService** : module de service web permettant d'accéder à certaines informations contebues dans la BD ePims....
-Un autre  module d'ePims, **eP-Core**, est également installé sur le serveur d'application J2EE et est utilisé par eP-Web et eP-WebService pour toute la partie d'accès aux données. En effet, eP-Core est la librairie de gestion des lectures/écritures et de créations des objets Java correspondants aux données de la BD.
-**eP-Back** utilise les web services proposés par eP-WebService pour lire les informations concernant les échantillons/études dans la BD et pour enregistrer les informations sur les acquisitions.
-{{wiki:epims4_0m1:archi_user.png|}}

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