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| Line 41: | Line 41: | ||
| * Nom : Deux fichiers sont considérés lorsqu'on considère les fichiers associés aux analyses. les fichiers correspondant à une analyse doivent avoir le même nom que l'analyse mais avec l'extension .pkl et .prp | * Nom : Deux fichiers sont considérés lorsqu'on considère les fichiers associés aux analyses. les fichiers correspondant à une analyse doivent avoir le même nom que l'analyse mais avec l'extension .pkl et .prp | ||
| * Localisation : tous les pkl doivent être localilsés dans un même répertoire (spécifié par l'utilisateur). Les prp sont recherchés dans le même répertoire que celui où sont les //raw files//. | * Localisation : tous les pkl doivent être localilsés dans un même répertoire (spécifié par l'utilisateur). Les prp sont recherchés dans le même répertoire que celui où sont les //raw files//. | ||
| + | |||
| Line 64: | Line 65: | ||
| * **Submitter** contient le nom de la personne responsable de l'échantillon ePims | * **Submitter** contient le nom de la personne responsable de l'échantillon ePims | ||
| + | \\ | ||
| + | __Fichiers spectres__ | ||
| - | Pour les spectres associés aux acquisitions, la règle attendu est : | ||
| * Nom : le nom du fichier de spectre pour une analyse est le même que le nom de l'analyse mais avec l'extention .mgf | * Nom : le nom du fichier de spectre pour une analyse est le même que le nom de l'analyse mais avec l'extention .mgf | ||
| * Localisation : les fichiers de spectres sont dans un sous-répertoire dta par rapport au répertoire contenant les raw file. | * Localisation : les fichiers de spectres sont dans un sous-répertoire dta par rapport au répertoire contenant les raw file. | ||
| Line 80: | Line 82: | ||
| * **operator** corresondant au responsable instrument passant les échantillons. Le nom spécifié doit correspondre au login ePims | * **operator** corresondant au responsable instrument passant les échantillons. Le nom spécifié doit correspondre au login ePims | ||
| - | Les spectres processés, au format MGF, doivent porter le même nom que le fichier d'acquisition et se trouver dans un sous répertoire //MGF// par rapport au répertoire contenant les acquisitions. | + | \\ |
| + | __Fichiers spectres__ | ||
| + | * Nom : Les spectres processés doivent porter le même nom que le fichier d'acquisition mais avec l'extension .mgf | ||
| + | * Localisation : les fichiers de spectres se trouvent dans un sous répertoire //MGF// par rapport au répertoire contenant les acquisitions. | ||
| + | \\ | ||
| + | __Remarque :__ | ||
| Il est possible qu'un fichier wiff contienne plusieurs acquisitions. Cette configuration est prise en compte par eP-Back. fichier wiff est alors copié une seule fois qu niveau de l'étude. En effet, le seul cas testé est celui où toutes les acquisitions d'un fichier wiff appartiennent à une même étude. | Il est possible qu'un fichier wiff contienne plusieurs acquisitions. Cette configuration est prise en compte par eP-Back. fichier wiff est alors copié une seule fois qu niveau de l'étude. En effet, le seul cas testé est celui où toutes les acquisitions d'un fichier wiff appartiennent à une même étude. | ||
| FIXME Autres cas à tester ... | FIXME Autres cas à tester ... | ||
| + | \\ | ||
| + | __Structure Projet__ | ||
| Au niveau d'Analyste (logiciel de commande du QTrap), il est possible de définir plusieurs projets. Chaque projet ayant une structure bien définie. | Au niveau d'Analyste (logiciel de commande du QTrap), il est possible de définir plusieurs projets. Chaque projet ayant une structure bien définie. | ||
| Le répertoire source spécifié à eP-Back peut se situer à deux niveaux: | Le répertoire source spécifié à eP-Back peut se situer à deux niveaux: | ||
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