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wiki:epims4_0:admin:rawdata

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-====== ​Format ​de données des spectrométres ======+====== ​Formatage ​de données des spectrométres ======
  
-eP-Back se charge de transférer les résultats d'​acquisition dans le repository d'​ePims. Pour se faire, eP-Back liste les fichiers d'​acquisition ​qui se trouvent sur le disque de l'​instrument (voir [[configurationePims#​eP-Back]]) et pour chaque ​fichier, tente de déterminer les informations suivantes :  +eP-Back se charge de transférer les fichier ​résultats d'​acquisition dans le repository d'​ePims ​et enregistre dans le système les acquisitions. Pour se faire, eP-Back liste les acquisitions ​qui se trouvent ​sur les fichiers résultats ​sur le disque de l'​instrument (voir [[configurationePims#​eP-Back]]) et pour chaque ​acquisition, tente de déterminer les informations suivantes :  
- +  * :!: **Le nom de l'​acquisition** ​: le résultat de l'​analyse sur l'​instrument d'un unique échantillon. Ce nom est unique pour chaque instrument. Si on génère un fichier pour chaque acquisition,​ alors le nom du fichier peut être utilisé comme nom d'​acquisition. 
-  * **Nom de l'​acquisition**  +  * :!: **Le nom ePims de l'échantillon** qui a été analysé. 
-  * **Le nom de l'étude ePims** à laquelle cette analyse se rattache +  * **Le nom de l'opérateur** qui a réalisé l'​analyse sur l'​instrument. Ce nom doit correspondre au login utilisé dans ePims.
-  * **Le nom ePims de l'échantillon** qui a été analysé+
   * **La date** de l'​acquisition   * **La date** de l'​acquisition
   * **La durée** de l'​acquisition   * **La durée** de l'​acquisition
-  * **La taille** du fichier d'​acquisition +  ​* **La description** de l'​acquisition 
- +  * **Le type** de l'​acquisition : Peut être soit un controle (LC ou Instrument) soit un blanc soit une recherche 
 +  * :!: **Le fichier résultat d'​acquisition** associé,  
 +  ​* **La taille** du fichier ​résultat ​d'​acquisition 
 +  * **les fichiers associés** c'​est-à-dire les spectres processés. 
 + 
 +Les informations précédée de :!: sont absolument requise pour que eP-Back puisse transférer les données. Si eP-Back ne parvient pas à les retrouver, vous devrez les rentrer manuellement pour chaque analyse dans l'​interface utilisateur d'​eP-Back (voir [[..:​user:​ePBack]]).  
 + 
 +=== Type de l'​acquisition === 
 + 
 +Pour qu'​eP-Back puisse déterminer automatiquement le type de l'​acquisition,​ le nom de l'​échantillon ePims peut contenir des valeurs clés :  
 +  - blanc : acquisition d'un blanc, 
 +  - controleLC : acquisition destinée à contrôler le bon fonctionnement de la chromatographie 
 +  - controleInst : acquisition destinée à contrôler le bon fonctionnement de l'​instrument 
 +  - test : acquisition de test, sans intérêt particulier. 
 + 
 +=== Sample list ===  
 +Si certaines de ces informations sont retrouvées automatiquement d'​autres doivent être saisies par l'​opérateur de l'​instrument dans certains champs de la //​sample-liste//​ de sorte qu'​elles apparaissent dans le fichier résultat d'​acquisition au moment où celui-ci est généré par l'​instrument. Les champs utilisés dans la //​sample-list//​ étant spécifiques à chaque instrument, les paragraphes suivants décrivent ce que doivent contenir les sample-list des instruments supportés par ePims pour qu'​eP-Back puisse retrouver automatiquement ces informations.  
 + 
 + 
 +Ces informations ont un impact sur le statut associé aux acquisitions,​ voir la [[..:​user:​epbackvisualisation#​les_informations | documentation d'​eP-Back]] 
 + 
 +Les constructeurs supportés sont : 
 +  * [[.:​rawdata_waters]] 
 +  * [[.:​rawdata_thermo]] 
 +  * [[.:​rawdata_applied]] 
 + 
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