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wiki:epims4_0:admin:configurationepims [2009/01/12 15:02] 132.168.75.60 |
wiki:epims4_0:admin:configurationepims [2009/01/14 16:09] 132.168.73.247 |
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epims.root: path complet au Pims root où eP-Back transfert les données. | epims.root: path complet au Pims root où eP-Back transfert les données. | ||
- | * Fichier ''./conf/instruments.xml'' : Configuration des instruments. Seuls les instruments connus d'ePims (et donc référencés dans la base de données ePims) pourront être reconnus par eP-Back. De plus le [[RawData|format de données spécifique au modèle de l'instrument]] doit être supporté par eP-Back. Le fichier de configuration pour les instruments est de la forme : | + | * Fichier ''./conf/instruments.xml'' : Configuration des instruments. Seuls les instruments connus d'ePims (et donc référencés dans la base de données ePims) pourront être reconnus par eP-Back. Le fichier de configuration pour les instruments est de la forme : |
<code xml> | <code xml> | ||
<instruments> | <instruments> | ||
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Il est possible de définir plusieurs configurations pour un même instruments, dans le cas, par exemple, ou les analyses sont générées dans plusieurs répertoires sources ... | Il est possible de définir plusieurs configurations pour un même instruments, dans le cas, par exemple, ou les analyses sont générées dans plusieurs répertoires sources ... | ||
- | Actuellement, les formats de données reconnus par eP-Back sont : | + | Pour ce qui est des données supportées, vous trouverez |
- | + | * La liste et les spécificités des formats supportés : [[.:supportedFormats]]. | |
- | * QTOF Waters | + | * La description du [[RawData]] nécessaire pour eP-Back |
- | * LTQ / LTQ-FT / OrbiTrap Thermo | + | |
- | * QTrap 4000 Applied | + | |
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Un schéma du contenu d'un message est donné ci-dessous. Pour spécifier une propriété il faut donner son chemin depuis l'objet !AcquisitionMessage. Ainsi pour tester le projet de rattachement de l'acquisition il faut spécifier sampleDescriptor.studyDescriptor.project | Un schéma du contenu d'un message est donné ci-dessous. Pour spécifier une propriété il faut donner son chemin depuis l'objet !AcquisitionMessage. Ainsi pour tester le projet de rattachement de l'acquisition il faut spécifier sampleDescriptor.studyDescriptor.project | ||
- | {{ .:ept-model.png }} | + | {{ .:ep-col-jmsacq.png }} |